BEOWOULF CLUSTER

[nasos89]

Γεια σας εδώ και καιρό προσπαθώ να φτιάξω ένα Beowulf cluster στο εργαστήριο της φυσικής στη σχολή στα πλαίσια της πτυχιακής μου. Το πρόβλημα είναι πώς τα tutorial που έχω βρει είναι ελλιπή και όχι τόσο επεξηγηματικά τουλάχιστον για έμενα όπου είναι 2 χρόνια χριστής ubuntu .Η έκδοση που έχουμε επιλέξει είναι το ubuntu 10.10 και η υλοποίηση είναι με mpi-mpich.Αν έχει ασχοληθεί κάποιος και έχει βρει κάποιο αξιόλογο οδηγό ακόμα και αν είναι με διαφορετικό τρόπο υλοποίησης ας μου δώσει τα φώτα του!!! Ευχαριστώ

[simosx]

Γεια σας εδώ και καιρό προσπαθώ να φτιάξω ένα Beowulf cluster στο εργαστήριο της φυσικής στη σχολή στα πλαίσια της πτυχιακής μου. Το πρόβλημα είναι πώς τα tutorial που έχω βρει είναι ελλιπή και όχι τόσο επεξηγηματικά τουλάχιστον για έμενα όπου είναι 2 χρόνια χριστής ubuntu .Η έκδοση που έχουμε επιλέξει είναι το ubuntu 10.10 και η υλοποίηση είναι με mpi-mpich.Αν έχει ασχοληθεί κάποιος και έχει βρει κάποιο αξιόλογο οδηγό ακόμα και αν είναι με διαφορετικό τρόπο υλοποίησης ας μου δώσει τα φώτα του!!! Ευχαριστώ

Τυπικά ο όρος τώρα είναι cluster computing. Ο όρος Beowulf ήταν σε χρήση πριν από δέκα χρόνια περίπου.
Μπορείς να κάνεις μια αναζήτηση για "cluster ubuntu" και να γράψεις μια μικρή περίληψη των αποτελεσμάτων; Θα βοηθήσουμε μετά με περισσότερες κατευθύνσεις.

[medigeek]

Δεν έχω ασχοληθεί με clusters, αλλά αν κατάλαβα καλά, είναι ένα είδος distributed/parallel computing;
Μήπως θα βοηθούσε να το κάνεις με το BOINC;
https://boinc.berkeley.edu/trac/wiki/DesktopGrid
https://boinc.berkeley.edu/trac/wiki/ProjectMain
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Project_list

BOINC can be used by anybody for their own distributed computing projects, either public or private.

[nasos89]

Γεια σας παιδιά καταρχήν θα ήθελα να σας ευχαριστήσω για για τις πληροφορίες και την άμεση ανταπόκριση. Ψάχνοντας βρήκα τον παρακάτω οδηγό .

http://www.ibm.com/developerworks/linux ... -cluster2/

Στο βήμα 3c λέει πως πρέπει να αντιγράψω τα αντίστοιχα κλειδιά που δημιουργούνται από το ssh-keygen -f /tmp/key -t dsa(το οποίο το αφήνω χωρίς να βάλω pass) από τα αρχεία key και key.pub. στα αρχεία /root/.ssh/identity και /root/.ssh/authorized_keys αντιστιχα.

Αντιμετωπίζω τα παρακάτω προβλήματα πρώτα cd /root/.ssh δεν με αφήνει να το κάνω μου βγαζει bash : cd : /root/.ssh : Permission denied
Με cd .ssh τα αρχεία που είναι μέσα στο φάκελο είναι της μορφής id_dsa id_dsa.pub.
Tο ερώτημα μου είναι τα αρχεία id_dsa και id_dsa.pub είναι τα αντίστοιχα αρχεία identity και authorized_keys που παρουσιάζονται στον οδηγό ??

Έψαξα και το BOINC αλλά από ότι κατάλαβα είναι για χρίση σε έτοιμα project και μέσω διαδικτύου .Ψάχνω κάτι που να είναι εφαρμόζεται σε τοπικό δίκτυο ,θα το αναφέρω παντός στους καθηγητές του εργαστήριου ίσως να το αξιοποιήσουν

[simosx]

http://www.ibm.com/developerworks/linux ... -cluster2/

Ο συγκεκριμένος οδηγός είναι από το 2005. Θα πρότεινα να ψάξεις για πιο πρόσφατη σελίδα.
Για παράδειγμα, για το mpich, δες https://help.ubuntu.com/community/MpichCluster

Ακόμα,
1. σε Ubuntu δεν είναι εφικτή η απευθείας σύνδεση σε root. Πρώτα συνδεόμαστε ως χρήστες και μετά κάνουμε sudo προς root, οπότε ξέρουμε από πιο λογαριασμό έγινε κάποιος root. Τα νεότερα πακέτα είναι ρυθμισμένα να λειτουργούν με αυτό το τρόπο.
2. Για να αντιγράψεις το δημόσιο κλειδί σε ένα εξυπηρετητή SSH, χρησιμοποίησε την εντολή ssh-copy-id

Κώδικας: Επιλογή όλων

Usage: /usr/bin/ssh-copy-id [-i [identity_file]] [user@]machine


που τα κάνει αυτόματα.

Πιστεύω ότι συνεχίζοντας την προσπάθεια και με ενημέρωση εδώ, θα καταφέρεις να ρυθμίσεις το λογισμικό σύντομα, και να το θέσεις σε λειτουργία.

[medigeek]

Έψαξα και το BOINC αλλά από ότι κατάλαβα είναι για χρίση σε έτοιμα project και μέσω διαδικτύου .Ψάχνω κάτι που να είναι εφαρμόζεται σε τοπικό δίκτυο ,θα το αναφέρω παντός στους καθηγητές του εργαστήριου ίσως να το αξιοποιήσουν

Ξανακάνω quote την δευτερη γραμμή στο wiki: "BOINC can be used by anybody for their own distributed computing projects, either public or private."
Επίσης υπάρχει και tutorial: https://boinc.berkeley.edu/trac/wiki/ProjectMain (quick start tutorial, Basic concepts, Adapting applications)
Αλλά αφού δεν έχεις ασχοληθεί με προγραμματισμό, μάλλον θα φανεί δύσκολο - νομίζω να αγνοήσουμε αυτή τη λύση.

[the_eye]

Δες και το ROCKS για cluster
http://www.rocksclusters.org/roll-docum ... ase/5.4.3/

Μεταφέρθηκε στην κατάλληλη ενότητα