αυτό στο κάνει μόνο στο aMSN? Το κάνει απο την στιγμή που το εγκατέστησες ή το απέκτησες κάποια στιγμή? Τι λειτουργικό έχεις; Καθαρά εγκατάσταση ή wubi?
και πήγαινε στον /home/to_username_sou και πάτα Control+H για να εμφανίσεις τα κρυφά αρχεία. Κάνε rename το .amsn σε κάτι άλλο (πχ .amsnold) και κλείσε τον nautilus
Κάνε logout και Login ξανά και άνοιξε το aMSN και δοκίμασε να αλλάξεις φωτό.