Από το αποτέλεσμα της εντολής
ls -l /home/username , φαίνεται πως είσαι εντάξει. Ιδιοκτήτης των προσωπικών σου φακέλων είσαι εσύ. Οπότε κάτι είχε γίνει πριν και είχαν αλλάξει τα δικαιώματα (και η ιδιοκτησία) στον φάκελο Downloads ή και σε άλλους.
Τώρα πιστεύω να λειτουργεί σωστά..
Μήπως είχες ανοίξει τον nautilus με δικαιώματα υπερχρήστη ; Θυμάσαι κάτι τέτοιο ;
Αν το πρόβλημα διορθώθηκε , τότε πάτα το πράσινο τικ
, στην απάντηση που νομίζεις πως βοήθησε στην λύση του προβλήματος.