το θέμα έχει ξαναψιλοσυζητηθει εδω:
viewtopic.php?f=4&t=163στο δικτυο υπαρχουν πολλά σχετικα βοηθήματα π.χ.
http://ubuntukids.org/blog/?p=69βασικό σημείο οταν εγκαθιστας σε εξωτερικο σκληρο πρεπει να διαλεξεις να εγκατασταθει ο boot loader στον εξωτερικο σκληρο δισκο:
IMPORTANT: When you get to the “Ready to install” screen you have to select the “Advanced” button and change the Boot Loader option from the default of (π.χ. hd0) to (π.χ. hd1). This ensures that GRUB gets loaded to the external drive and not on the internal hard drive where it will fail to work properly if the external drive isn’t connected.
Αν το κάνεις έτσι θα πρέπει απλώς καθε φορα που θες να bootαρεις απο τον εξωτερικο σκληρο ... να αλλαζεις την σειρα προτιμησης στο BIOS σου.
Υπάρχουνε κι άλλες λύσεις αυτην είναι η πιο απλή και ασφαλης.